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Bonjour,
En chimie, l'atome qui est représenté par la couleur bleue est l'atome d'azote.
Il n'y a pas de raison spécifique, on l'a instauré conventionnellement pour s'en servir dans la représentation moléculaire 3D.
Les autres couleurs conventionnelles sont :
En noir ➡️ Carbonne
En rouge ➡️ Oxygène
En blanc ➡️ Hydrogène
En jaune ➡️ Soufre
En vert ➡️ Chlore
Bonne journée !