Chez les copépodes les sexes sont toujours séparés. La reproduction nécessite un accouplement car contrairement à beaucoup d'autres espèces aquatiques les gamètes ne sont pas émises directement dans le milieu. La reproduction à lieu toute l'année ou est au contraire saisonnière selon les espèces. L'adoption de l'un ou l'autre de ces comportements dépend souvent du rythme et de l'abondance des ressources nutritives ainsi que de la température.
