Le gène déficient à l'origine de la maladie est situé sur le chromosome X qui est un des deux chromosomes sexuels avec le chromosome Y. Les femmes sont porteuses de deux chromosomes X. Si l'un des deux est porteur de la maladie, l'autre est probablement sain, ce qui limite l'expression de la maladie chez la femme. Les hommes en revanche possèdent un chromosome X et un chromosome Y. Si le chromosome X est atteint, la maladie s'exprimera forcément et complètement puisqu'il s'agit du seul chromosome X qu'il possède.
Si un homme hémophile a un enfant fille, c'est qu'il aura transmis son seul chromosome X. Cette fille sera donc porteuse sans être malade (puisque en tant que fille elle aura un deuxième chromosome X hérité de sa mère). Si cette fille a des enfants, elle transmettra au hasard le chromosome malade ou le chromosome sain.
